Aves
Las quebradas, cursos de agua, e humedales da cobijo para un amplio rango de aves del ecosistema alto andino. Aves notables que suele avistar son el picaflor cordillerano, perico cordillerano, chorlito cordillerano, y aves rapaces como el cernícalo, águila chilena, carancho y condor.
Para más información consulta el sitio eBird del Parque – http://ebird.org/ebird/chile/

Fauna

Las especies más comunes de ver son las avifauna, pero un visitante suele tener encuentros con el cururo, el zorro culpeo, el liebre, y los ratoncitos. Ha habido avistamientos recientes de guanacos y vizcachas.

Parque Andino Juncal se encuentra dentro del lugar de desplazamiento de una serie de fauna, que incluye el puma, el guanaco, el gato montes, el zorro, la vizcacha, y el cururo.

Flora

El Valle de Juncal ha habido el sitio de interés regular por la alta representatividad, y acceso a, flora nativa e endémica alto andino. Hemos sido visitado por grupos botánicos nacionales, como del Jardín Botánico Chagual, e internacionales, como del Royal Botanic Garden Edinburgh. Dentro de las especies interesantes son la Alstroemeria Spathulata y la familia de Rodophiala. Hay aproximadamente 70 especies de flora identificadas en el parque, la mayoría nativas o endémicas.